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蛋白質(zhì)磷酸化修飾（Phosphorylation）

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蛋白質(zhì)磷酸化修飾（Phosphorylation）

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項(xiàng)目介紹

     蛋白質(zhì)磷酸化修飾（Phosphorylation）是生物體內(nèi)最重要的共價(jià)修飾方式之一，是目前分布最多、也是最廣泛研究的修飾，其發(fā)生過程是在激酶（kinase）催化下，將ATP的磷酸根基團(tuán)轉(zhuǎn)移到蛋白的氨基酸（Ser、Tyr、Thr）側(cè)鏈上。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程調(diào)節(jié)著包括細(xì)胞增殖、發(fā)育、分化、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞凋亡、神經(jīng)活動(dòng)、肌肉收縮及腫瘤發(fā)生等過程在內(nèi)的所有生命活動(dòng)。發(fā)生磷酸化修飾的氨基酸上共價(jià)連接磷酸基團(tuán)，其分子質(zhì)量會(huì)增加發(fā)生79.97Da。利用質(zhì)譜可測定分子量是否發(fā)生79.97Da的質(zhì)量偏移，從而檢測磷酸化修飾肽段及位點(diǎn)。 4D-label free磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)是基于timsTOF Pro質(zhì)譜儀，通過數(shù)據(jù)依賴性采集-同步累積連續(xù)碎裂（ddaPASEF）掃描模式進(jìn)行差異磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析。4D-label free修飾組，利用了離子淌度分離，能根據(jù)分子的形狀、截面積屬性，可有效區(qū)分修飾同分異構(gòu)多肽，極大提高修飾的鑒定深度，以更少上樣量、更快掃描速度，實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)組學(xué)在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。

技術(shù)路線

技術(shù)優(yōu)勢

1. 4D技術(shù)加持，提高定量的準(zhǔn)確性、鑒定深度，更加適合微量樣本；

2. 克服標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在樣本數(shù)量上的限制，靈活方便；

3. 基于質(zhì)譜平臺(tái)（Bruker timsTOF pro），檢測速度提升近一倍；

4. 經(jīng)驗(yàn)豐富——超17年蛋白平臺(tái)服務(wù)經(jīng)驗(yàn)，擁有豐富的高水平項(xiàng)目文章；

5. 數(shù)據(jù)保證——采用進(jìn)口金標(biāo)抗體，數(shù)據(jù)結(jié)果穩(wěn)定可靠；

6. 系統(tǒng)解決方案——提供修飾組學(xué)至驗(yàn)證、上下游聯(lián)合分析，實(shí)現(xiàn)快捷”一站式”服務(wù)。

數(shù)據(jù)分析

1、標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容

鑒定分析：鑒定與定量結(jié)果統(tǒng)計(jì);單個(gè)樣本蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果統(tǒng)計(jì);韋恩圖。

表達(dá)差異分析：差異結(jié)果統(tǒng)計(jì);差異結(jié)果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖。

多組的比較分析(組別>=3)：mufzz聚類;雷達(dá)圖;箱線圖。

功能分析：亞細(xì)胞定位;結(jié)構(gòu)域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網(wǎng)絡(luò)分析。

質(zhì)量控制分析：肽段離子質(zhì)量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質(zhì)豐度比分布。

2、高級(jí)數(shù)據(jù)分析

功能分析：GSEA富集分析。

臨床藥物研究：藥物靶點(diǎn)注釋。

標(biāo)志物篩選：集成機(jī)器學(xué)習(xí)。

與臨床表征的聯(lián)合分析：熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析。

推薦組合產(chǎn)品

1. 蛋白質(zhì)組+磷酸化組：全面剖析機(jī)體調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。

2. 磷酸化組+代謝組：打通機(jī)體表型-機(jī)制研究通路。

推薦應(yīng)用領(lǐng)域

1. 神經(jīng)及退行性疾??；

2. 腫瘤發(fā)病機(jī)制研究；

3. 藥理藥靶研究。


樣品要求

項(xiàng)目案例
學(xué)術(shù)文章

蛋白質(zhì)磷酸化修飾（Phosphorylation）

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