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    二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

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    項(xiàng)目介紹

         二級(jí)結(jié)構(gòu)是指多肽鏈借助于氫鍵沿一維方向排列成具有周期性的結(jié)構(gòu)的構(gòu)象，是多肽鏈局部的空間結(jié)構(gòu)（構(gòu)象）, 主要有α－螺旋、β－折疊和無(wú)規(guī)則卷曲（Coil）三種形式。不同蛋白質(zhì)翻譯后修飾發(fā)生位置在蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)上具有一定差異化選擇。例如在某些情況下，蛋白質(zhì)的磷酸化位點(diǎn)傾向于發(fā)生在無(wú)規(guī)則卷曲區(qū)域內(nèi)；而在其他情況下，則傾向發(fā)生在結(jié)構(gòu)良好的區(qū)域。該分析結(jié)果用于評(píng)估修飾蛋白中修飾氨基酸二級(jí)結(jié)構(gòu)的偏好性選擇。

    分析方法

          采用 NetSurfP1.0 軟件進(jìn)行二級(jí)結(jié)構(gòu)分析，然后 Wilcoxon Rank Sum 檢驗(yàn)方法計(jì)算顯著差異變化 p value。


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    項(xiàng)目案例

    蛋白翻譯后修飾位點(diǎn)二級(jí)結(jié)構(gòu)分布統(tǒng)計(jì)圖

    學(xué)術(shù)文章

    二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

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